大棚西瓜一般在4月下旬至5月上中旬開花，因為這時大棚內無昆蟲活動必須進行人工授粉。根據大棚膝蓋骨開花特性，授粉時間以上午8-9時最佳，陰雨天可適當推遲授粉。
也可以在陰雨天提前一天取回含苞雄花，置室內干燥處在次日上午開放后授粉。為提高坐果率可對主蔓.側蔓上的雌花都授粉，也可以給第一.第二.第三雌花授粉，以便有選瓜余地。為保證坐果穩定，還應當選擇耐低溫.耐弱光.易坐果的品種在大棚種植。目前生產上栽培面積較大.表現較好的品種有黑美人.冠龍.新紅寶.京欣等各地應根據當地情況選用。
陰雨多的年份貨植株徒長時也可以考慮授粉后在輔助坐瓜靈處理。為提高單瓜重量和使瓜型端正，應盡量選留第2雌花上坐的瓜。當幼瓜長到雞蛋大時，應在每株選留1個瓜柄粗.果型圓整.發育快的幼苗西瓜，并優先留主蔓上的幼瓜，將其余的瓜摘除。大棚搭架栽培的西瓜，由于果實生長在良好的小氣候下只要管理加強，可生產種植出果型端正.皮毛鮮艷.品質上好的優質西瓜。
